Εντάχθηκε  στο τομεακό πρόγραμμα ανάπτυξης το έργο εκβάθυνσης του λιμανιού του  του Αγίου Ευστρατίου, συνολικού προϋπολογισμού 320.000 ευρώ, με απόφαση που υπέγραψε το Υπουργείο Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής. Ειδικότερα σύμφωνα με ανακοίνωση του Υπουργείου Ναυτιλίας , το έργο χρηματοδοτείται μέσω του Τομεακού Προγράμματος Ανάπτυξης και του Υποπρογράμματος Α’, με τίτλο «Ενίσχυση της Ναυτιλίας, της Εθνικής Λιμενικής Στρατηγικής και της Ασφάλειας και της Προστασίας στον Θαλάσσιο Χώρο».

Η υλοποίηση του έργου εντάσσεται στον Ειδικό Αναπτυξιακό Στόχο 4Β «Μεταφορές» και αποσκοπεί στη βελτίωση της λειτουργικότητας του λιμένα. Η εκβάθυνση θα επιτρέψει την προσέγγιση μεγαλύτερων πλοίων, ενισχύοντας έτσι την ακτοπλοϊκή σύνδεση και την εμπορική δραστηριότητα του.

Το έργο εκβάθυνσης του λιμένα θεωρείται κομβικής σημασίας για τον Άγιο Ευστράτιο. Με τη δυνατότητα φιλοξενίας πλοίων μεγαλύτερης χωρητικότητας, θα ενισχυθεί η διασύνδεση του νησιού τόσο με την ηπειρωτική χώρα όσο και με τα υπόλοιπα νησιά, δίνοντας ώθηση στην οικονομική και τουριστική του ανάπτυξη.

Το Υπουργείο Ναυτιλίας και Νησιωτικής Πολιτικής, μέσα από τέτοιες πρωτοβουλίες, επενδύει σταθερά στη βελτίωση των υποδομών στα νησιά, στοχεύοντας σε πιο ασφαλείς και αποδοτικές θαλάσσιες μεταφορές.